Основано в 1870 г. В 1926 году состояло из 56 хозяйств, основное население — русские. В составе Криволуцкого сельсовета Александровского района Томского округа Сибирского края.
Муниципальное образование «Лукашкин-Ярское сельское поселение» входит в состав муниципального образования «Александровский район», созданного на основании Закона Томской области «О наделении статусом муниципального района, сельского поселения и установлении границ муниципальных образований на территории Александровского района», утверждённым Постановлением Государственной Думы Томской области от 30.09.2004 № 1487.
Административный центр муниципального образования «Лукашкин-Ярское сельское поселение» — село Лукашкин Яр.